1、减少化肥的用量，提高化肥利用率
随着化肥的大量使用，其利用率不断降低已是众所周知的事实。这说明，仅靠大量增施化肥来提高作物产量是有限的。微生物肥料在解决这方面问题上有独到的作用。所以，根据我国作物种类和土壤条件，采用微生物肥料与化肥配合施用，既能保证增产，又减少了化肥使用量，降低成本，同时还能改 善土壤及作物品质，减少污染。
2、制造和协助农作物吸收营养，提高产量
EM有益活 性菌肥施用后，由于微生物的活动，不仅能增加土壤有 效养分，还能产生多种激 素类物质和各种维生素，从而促 进作物的生长；生物菌可以与多种植物根共生，其菌丝伸出根部很远，可以吸收更多的营养供各种植物利用，其中以对磷的吸 收颇为明显，吸收的营养多了，产量自然高。
3、增强植物的抗逆性，提高植物的抗病害能力
EM有益活 性菌菌种接种后，由于在作物根部大量生长繁殖，成为作物根际的优势菌，它们可分泌抗真 菌和细 菌的抗 生 素，从而抑 制多种病菌的生长，提高了作物的抗病能力。由于在作物根部的大量生长，除了可以吸收有益于作物生长的营养元素外，还可增加作物对水分的吸收，提高作物的抗旱能力。
4、改良土壤，防 治土传病害
微生物肥料中的EM有益活 性菌能产生糖类物质，占土壤有 机质的百分之零点一，与植物粘液，矿物胚体和有 机胶体结合在一起，可以改 善土壤团粒结构，增强土壤的物理性能和减少土壤颗粒的损失，在一定的条件下，还能参与腐植质形成，所以施用微生物肥料能改
善土壤物理性状，有利于提高土壤肥力。
我们不仅要注重作物的产量，更要注重产品的质量，不仅使我们的土地长出更多的庄稼，而且还要是我们的土地得到可持续的发展，所以说生物菌有 机肥在改良土壤方面的作用是不可小视的。